Czas podróży z Nowego Targu do Zakopanego wynosi 24 minuty. Podróżni mogą skorzystać z „Taryfy Podhalańskiej”, czyli specjalnej oferty biletowej – dzięki niej na jednym bilecie można podróżować koleją i komunikacją miejską w Zakopanem i Nowym Targu. Cena godzinnego biletu wynosi 5,60 zł, natomiast dwugodzinnego 7,60. Powrót z Zakopanego do Nowego Targu kosztuje 4 zł. Na wszystkie połączenia obowiązują ustawowe ulgi.
Podhalańska Kolej Regionalna to projekt realizowany wspólnie przez Przewozy Regionalne, Urząd Marszałkowski Województwa Małopolskiego i podhalańskie samorządy.